プロローグ 宇宙世紀０２５８・・・。ついに叶った、宇宙の格コロニーの独立、及び、議会軍との和解。地球食糧危機からの脱出。 人間は、一つの、結末を迎えた・・・。コロニーはその名称を "セツルメント"と名を変え、今までの幾多の戦争の傷跡は時の流れという物と共に消えていった・・・・。 　　　　　しかし、そう長くも続かなかった・・・。 地球から、一番奥のセツルメントの、ちょうど中間に位置するセツルメント、シグマセツルメントが、セツルメント生放送番組内で、地球に対しての「人類進化計画」を発表した。シグマセツルメントの総帥、ジング・シグマは、格セツルメントをその武力で次々と制圧し、地球に艦隊を送り込んでいた。弱体化していた、議会軍は無力に等しく、開戦から、四ヶ月して、シグマが連邦本部の各地をほとんど、制圧してしまったのだった・・・ 事の重大さに気づいた議会軍は、新型ＭＳの開発に乗り出す。 そして、五ヶ月が経ち、シグマ遊撃特務部隊、ブレイジングＭＳ部隊を設立。ニューヤークを拠点に世界各地を転々とし、シグマの基地を潰すのが目的である。 その部隊の存在は敵にも脅威であった。議会軍内のエースパイロットが集まった部隊だからだ。形勢は膠着状態にまで落ちたが、シグマセツルメントから降下してくる艦隊は多く、議会軍の方が、戦力的には不利であった・・・・。 この物語は、ブレイジングＭＳ部隊の１９歳にして、若き天才パイロットのセイル・ギア少尉が、自分の専用機で出撃する所から始まる・・・・。

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